Учредитель Фонда «Вольное Дело» Олег Дерипаска – выпускник физического факультета МГУ им. М.В.Ломоносова.

В рамках программы Alma Mater реализуется ряд системных крупных проектов с МГУ им. М.В.Ломоносова. В частности, Фонд «Вольное Дело» инициировал и предоставил средства на создание Московской школы экономики (МШЭ - МГУ) и Высшей школы государственного администрирования (ВШГА). Фонд также систематически помогает физическому факультету МГУ и участвует в инновационных программах развития университета в целом.